Populære Innlegg

Redaksjonens - 2019

Analyse av komplekse proteininteraksjoner

Anonim

Sammensetningen av spesifikke funksjonelle proteinkomplekser i deres cellulære miljø kan nå analyseres med enestående løsning. Teamet ledet av junior gruppeleder Dr Julien Béthune ved Heidelberg University Biochemistry Center har utviklet en ny teknikk som gjør at forskerne kan overvinne en langvarig hindring i molekylærcellebiologi. Metoden som heter "split-BioID" tillater dem å analysere kontekstavhengige proteinkomplekser som ikke kunne identifiseres tidligere. Deres forskningsresultater ble publisert i tidsskriftet Nature Communications .

annonse


Genomet av levende organismer koder for titusener av proteiner som utfører de fleste cellulære funksjoner. For å oppfylle sine oppgaver, må proteinene samhandle for å danne store makromolekylære sammenstillinger. Identifikasjonen av protein-protein-interaksjoner i slike komplekser har således vært en avgjørende oppgave innen molekylcellebiologi. Men en stor utfordring kommer fra den dynamiske naturen til disse forsamlingene. "Typisk er et enkelt protein en del av flere tydelige og ofte overlappende komplekser som ombygges i henhold til den cellulære konteksten og den fysiologiske funksjonen som skal utøves", forklarer Dr Béthune. "Til dags dato forhindret mangelen på analytiske teknikker med tilstrekkelig oppløsning enkel tildeling av protein-protein-interaksjoner til bestemte funksjonelle komplekser."

I forskningen kombinerer forskerne to eksisterende tilnærminger: En analyse kalles BioID for å identifisere mulige protein-til-protein-interaksjoner med merkingsteknikker og konseptet "Protein-Fragments Complementation Assay" (PCA), en metode for å validere interaksjoner mellom to proteiner. "Sammenlignet med konvensjonelle metoder gir romanen" split-BioID "en fremragende spatitemporal oppløsning som muliggjør enkel analyse av kontekstavhengige proteinkomplekser, " understreker Isabel Schopp, en doktorand i Béthune-forskergruppen og hovedforfatter av studien . Forskerne håper nå å få en bedre forståelse av hvordan celler reagerer dynamisk med deres omgivelser.

annonse



Historie Kilde:

Materialer levert av Heidelberg, Universität . Merk: Innholdet kan redigeres for stil og lengde.


Tidsreferanse :

  1. Isabel Myriam Schopp, Cinthia Claudia Amaya Ramirez, Jerneja Debeljak, Elisa Kreibich, Merle Skribbe, Klemens Wild, Julien Béthune. Split-BioID en betinget proteomikk tilnærming til å overvåke sammensetningen av spatiotemporalt definerte proteinkomplekser . Naturkommunikasjon, 2017; 8: 15690 DOI: 10, 1038 / ncomms15690