Populære Innlegg

Redaksjonens - 2019

Brystkreftrisiko kvantifisert basert på sjeldne varianter og bakgrunnsrisiko

Anonim

Sjeldne varianter kombinert med bakgrunnsgenetiske risikofaktorer kan utgjøre mange uforklarlige tilfeller av familiær brystkreft, og å vite at de spesifikke generene som er involvert, kunne informere valg av forebyggings- og behandlingsstrategier, ifølge funn som ble presentert i en plenum på American Society of Human Genetics ( ASHG) 2017 Årsmøte i Orlando, Fla.

annonse


Forskere Na Li, MD, som presenterte arbeidet; Ian Campbell, PhD, lederforsker; og deres kollegaer på Peter MacCallum Cancer Center i Melbourne, Australia, fokuserte sin studie på pasienter med høy risiko for brystkreft: de med personlig eller familiehistorie som var på utkikk etter en forklaring.

"Når du vet hvilket gen som gir risikoen for brystkreft, kan du gi et mer presist estimat av risiko, vet hva du kan forvente og passe på og skreddersy risikostyringsstrategier til pasienten, " sa Dr. Campbell. Dessverre, i omtrent halvparten av disse høyrisikopatienter ble det ikke funnet noen kjent genetisk årsak, noe som tyder på en mer komplisert forklaring. I slike tilfeller hadde kreftgenetikere lenge mistenkt at polygenerisk risiko (risiko forbundet med en kombinasjon av genetiske varianter) var involvert.

Gen arbeider ikke alene, men som en del av ens generelle genetiske sammenheng, forklarte Dr. Li. "Den" polygeniske risikoen "bakgrunn er som et landskap fullt av åser og daler, med hver risikofylt variant som et hus på toppen av det, " sa hun. "Hvis du arver en høyrisikovariant - et høyt hus - men bor i en dal, kan din generelle risiko for brystkreft ende opp med å bli gjennomsnittlig fordi ditt genetiske landskap drar det ned."

Begrepet bakgrunnsmetrisk risiko er ikke ny, men i mange år har forskere ikke hatt verktøy for å samle inn og analysere tusenvis av genomene som trengs for å kvantifisere det. Nylige forbedringer i neste generasjons sekvenseringsteknologi har håndtert denne utfordringen. Som et resultat var Dr. Li og kolleger i stand til å sekvensere opptil 1400 kandidatbrystkreftgener i 6000 familiære brystkreftpatienter og 6000 kreftfrie kontroller. I denne store prøven søkte de etter potensielle kreftassosierte gener som ble foreslått av litteraturen, samarbeidspartnere og deres egne tidligere resultater, og identifiserte minst 46 gener som var minst dobbelt så sannsynlige at de hadde mutasjoner blant deltakerne med brystkreft enn i disse uten.

De brukte også dataene til å beregne en polygen risiko score for hver pasient, og kombinert denne poengsum med data på deres høye og moderate risikovarianter for å estimere hver pasients samlede risiko for å utvikle brystkreft. I de kommende årene planlegger forskerne å utvide studien internasjonalt for å teste og forfinne sine funn over befolkningene. De håper også å ta med disse mer presise risikovurderinger til klinikken, for å sikre kvinner mer nøyaktig om deres personlige risiko for kreft, eller - hvis risikoen er høy - gi forebyggende strategier som screening i yngre alder.

annonse



Historie Kilde:

Materialer levert av American Society of Human Genetics . Merk: Innholdet kan redigeres for stil og lengde.