Populære Innlegg

Redaksjonens - 2019

Gap lukket i det genetiske kartet av sopp: Forskningsteam sekvenser genom av Pyronema confluens

Anonim

Et internasjonalt forskergruppe under ledelse av PD Dr Minou Nowrousian fra Ruhr-Universität Bochum (RUB) har sekvensert genomet av ascomycete Pyronema confluens, og dermed lukker et gap i det genetiske kart over sopp. For første gang har forskere vist for sopp som i alle genomene utvikler de genene som er aktive under seksuell utvikling raskere enn andre gener. En lignende effekt ble allerede beskrevet for dyr og planter; for sopp, var imidlertid dette spørsmålet knapt blitt adressert i det hele tatt. Teamet fra Tyskland, Spania og USA har publisert sine funn i PLoS Genetics .

annonse


Pyronema - en typisk representant for den systematiske gruppen

I dag har genomene på mer enn 250 sopp blitt sekvensert. Blant de basale filamentøse ascomycetene - en gruppe ascomycetes som inkluderer bl.a. trøfler og moreler - har bare en representant blitt analysert så langt: trffel Tuber melanosporum . "Med 125 millioner basepar er trffelgenomet uvanlig stort, men det kodes for relativt få gener, nemlig noen 7.500, " sier Minou Nowrousian fra Institutt for generell og molekylær botanikk. "Inntil nå var det ikke klart om dette er typisk for basal filamentøse ascomycetes eller om det er forårsaket av trffelens 'atypiske' livsstil." I motsetning til andre filamentøse ascomycetes utvikler trffelen ikke reproduktive organer - såkalte fruiting bodies - over bakken, men heller under jorden. Videre vokser det bare i symbiose med planterøtter (mycorrhiza). Pyronema, derimot, er en typisk representant for sin gruppe.

Mellomliggende evolusjonære scenen

Genomet av Pyronema confluens inneholder 50 millioner basepar og noen 13.000 gener; Det er dermed mindre enn trøffelens, og likevel inneholder det flere gener. Disse funnene bekrefter trøffelens spesielle posisjon og gir ny innsikt i utviklingen av ascomycetene. " Pyronema confluens har sterkere likhet med høyere ascomycetes enn til trøffel, " konkluderer Minou Nowrousian. Imidlertid har forskerne også oppdaget forskjeller i høyere ascomycetes, for eksempel i DNA-sekvensen som inneholder den genetiske blåkopien for parringstype gener. Parringstype gener er de viktigste regulatorene for seksuell utvikling, og i Pyronema confluens viser de ikke den standardiserte strukturen som er typisk for høyere ascomycetes. " Pyronema confluens kan representere et mellomliggende evolusjonsstadium i utviklingen av parringstype gener, " sier Bochum-biologen.

Lysaktiverte gener

Et karakteristisk trekk ved svampen som undersøkes, er det faktum at det produserer fruktlegemer bare i lys. Passende oppdaget forskerne gener i Pyronema- genomet som inneholdt tegninger for fotoreceptorer for forskjellige bølgelengder av synlig lys. Aktiviteten til noen av disse genene økte i lys.

annonse



Historie Kilde:

Materialer levert av Ruhr-Universitaet-Bochum . Merk: Innholdet kan redigeres for stil og lengde.


Tidsreferanse :

  1. Stefanie Traeger, Florian Altegoer, Michael Freitag, Toni Gabaldon, Frank Kempken, Abhishek Kumar, Marina Marcet-Houben, Stefanie Pöggeler, Jason E. Stajich, Minou Nowrousian. Genomet og utvikling-avhengige transcriptomes av pyronema confluens: et vindu i svampevolution . PLoS Genetics, 2013; 9 (9): e1003820 DOI: 10.1371 / journal.pgen.1003820