Populære Innlegg

Redaksjonens - 2019

Genetiske "fossiler" avslører langsiktige virale partnerskap i gress

Anonim

Defekte virus innarbeidet i gressgenomer kan tilpasse seg til å danne partnerskap med andre genom-innlemmede virus for å fullføre livssyklusen, ifølge en ny PLOS Pathogens- studie. Resultatene tyder på at partnervirusene utvikler seg i konsert, slik at de kan opprettholde sitt forhold over tid.

annonse


Genomene av dyr, planter og sopp inneholder strekninger av DNA som stammer fra virus, integrert i gamle vertsgener etter infeksjon, og ble sendt ned til vertsavkom. Disse virale "fossilene" gir mulighet til å studere interaksjoner mellom virus i vertsceller i en evolusjonær skala.

For bedre å forstå viral interaksjoner, fokuserte Sunlu Chen og kollegaer ved Hokkaido University, Japan, på virusfossiler som gikk ned fra gamle gress i Poaceae-gressfamilien. Spesielt var de interessert i fossiler av virus kjent som pararetroviruser (PRVs), som ikke integreres i verts DNA som en del av deres normale livssyklus, men kan i tilfelle forlate viral "fossil" i vertsgener, samtidig som de beholder evnen til å fullføre deres Livssyklus."

Forskerne sekvenserte og analyserte PRV-fossiler integrert i moderne gressgener og identifiserte flere forskjellige PRV-arter, hvorav tre ble funnet å være defekte. Disse defekte artene manglet DNA som koder for proteiner som trengs av PRVs for å samordne vertscellemaskiner og lage nye kopier av viruset, og fullføre livscyklusen.

For å undersøke hvordan defekte PRVer fremdeles kan fullføre livssyklusen, analyserte forskerne genetiske forhold mellom de fossile PRV-sekvensene. De fant ut at en defekt PRV-art kan ha utviklet seg for å danne et kommensal forhold med en ikke-defekt art, slik at den kan bruke det ikke-defekte proteinmaskiner for å fullføre livssyklusen.

Bevis tyder på at de to andre defekte PRVene kan ha utviklet et mutualistisk partnerskap, hvor hver art gir komplementær proteinmateriell som mangler av de andre artene.

Forskningsgruppen fant at de to artene i hvert partnerskap ofte har byttet DNA strekker kalt noncoding regulatoriske sekvenser (NRSs) med hverandre over tid. Denne samordnede utviklingen har resultert i at de samarbeidspartiene deler svært liknende NRS, og det ser ut til å ha muliggjort utvikling og vedlikehold av partnerskapene over tid.

"Virusfossiler i gresgenomene viste at defekte pararetrovirusarter var velstående på grunn av kompensasjoner av funksjonsfeil ved partnerskap med intakte virus eller med komplementære defekte virus."

annonse



Historie Kilde:

Materialer levert av PLOS . Merk: Innholdet kan redigeres for stil og lengde.


Tidsreferanse :

  1. Sunlu Chen, Huizhen Zheng, Yuji Kishima. Genomiske fossiler avslører tilpasning av ikke-autonome pararetroviruser drevet av samordnet utvikling av ikke-kodende regulatoriske sekvenser . PLOS Pathogens, 2017; 13 (6): e1006413 DOI: 10.1371 / journal.ppat.1006413