Populære Innlegg

Redaksjonens - 2019

Massiv dataanalyse viser hva som driver spredning av influensa i USA

SCP-3426 A Spark Into the Night | Keter class | k-class scenario / planet scp (Juni 2019).

Anonim

Ved hjelp av flere store datasett som beskriver helsevesen, geografiske bevegelser og demografi på mer enn 150 millioner mennesker over ni år, har forskere ved University of Chicago skapt modeller som forutsier spredningen av influensa i USA hvert år.

annonse


De viser at sesonginfluensautbrudd stammer fra varme, fuktige områder i sør og sørøstlige USA, og beveger seg nordover, bort fra kysten. Tilnærmingen er forskjellig fra tradisjonelle influensa sporing modeller som er avhengige av overføringshastigheter, eller forventet antall personer som kan bli syk og sende viruset sammen til andre. I stedet bruker de nye modellene flere andre faktorer som påvirker disse overføringshastighetene. Studien ble publisert Februrary 27 i tidsskriftet eLife .

"Det er et svært høyoppløselig bilde, kanskje enda høyere enn hva Centers for Disease Control and Prevention kan se, fordi det inneholder så mange datakilder, " sa Andrey Rzhetsky, PhD, studiens seniorforfatter og Edna K. Papazian Professor av medisin og human genetikk ved UChicago.

Rzhetsky og Ishanu Chattopadhyay, ph.d., professor i medisin ved UChicago og studiens hovedforfatter, begynte med helsepersonell fra Truven MarketScan, en database med avidentifiserte pasientdata fra over 40 millioner familier i USA. De analyserte ni influensasesonger, fra 2003 til 2011, flagg forsikringskrav for behandling av influensalignende symptomer. Disse dataene viser når og hvor hvert influensautbrudd begynner og genererer "strømmer" for å spore spredningen fra fylke til fylke. Kilde fylkene pleide å være på kysten i nærheten av Mexicogolfen eller Atlanterhavet.

Forskerne analyserte også 1, 7 milliarder geografiske meldinger fra Twitter over en tre og et halvt år for å fange folks ukentlige reisemønstre mellom fylkene. For eksempel, hvis noen rutinemessig tweets hjemmefra, deretter tweets fra jobb eller mens de besøker familie i neste fylke, vil dette etablere et mønster av bevegelse mellom de to fylkene.

Analysen inneholdt også data om "sosial tilkobling", som inkluderte estimater av hvor ofte folk besøker nære venner og naboer, flyselskap, vær, vaksinasjonshastigheter og endringer i influensaviruset selv.

Teamet kombinerte alle disse datapunktene for å tegne et bilde av hvilke faktorer som driver det nordlige spredningen av influensa hvert år. I papiret ligner de det typiske utbruddet til en skogbrann. For å spre seg, trenger en brann brannfarlig, tørr tinder, en startende gnist og vind for å fremskynde bevegelsen. I det sørlige USA har folk en høy grad av sosial tilkobling. Antall nær venner, venner som også er naboer og samfunn av mennesker som alle kjenner hverandre, er mye høyere enn landet som helhet, noe som betyr at de har mange muligheter til å spre influensa.

Denne høye sosiale forbindelsen er det brannfarlige materialet. Gnisten er det varme, fuktige været på sørkysten, og vinden er den kollektive bevegelsen til alle disse menneskene, over korte avstander etter land, mens de kjører fra fylke til fylke.

Forskerne var i stand til å bruke disse modellene for å gjenskape tre års data om historisk influensa ganske nøyaktig. Rzhetsky sa at etter hvert som de første rapportene om influensa begynner å komme hvert fall, kan disse verktøyene brukes til å hjelpe offentlige helsepersonell til å fokusere på forebyggingsarbeid.

"Hvis for eksempel influensalignende symptomer blir rapportert i et fylke, kan du fortelle folk i nabolandene å holde seg borte fra folkemengdene, eller du kan fokusere vaksinasjonsarbeidet på enkelte steder på forhånd, " sa han. "Det kan brukes i hovedsak som værvarsel for influensa."

annonse



Historie Kilde:

Materialer levert av University of Chicago Medical Center . Original skrevet av Matt Wood. Merk: Innholdet kan redigeres for stil og lengde.


Tidsreferanse :

  1. Ishanu Chattopadhyay, Emre Kiciman, Joshua W Elliott, Jeffrey L Shaman, Andrey Rzhetsky. Konjunktjon av faktorer som utløser bølger av sesonginfluensa . eLife, 2018; 7 DOI: 10.7554 / eLife.30756