Populære Innlegg

Redaksjonens - 2019

Molekylær kartlegging gjorde det enkelt

Anonim

Hver dag kommer hver tommers hud på kroppen din i kontakt med tusenvis av molekyler - fra mat, kosmetikk, svette, mikrober som kaller huden din hjemme. Nå kan forskere lage interaktive 3D-kart som viser hvor hvert molekyl ligger på kroppen din, takket være en ny metode utviklet av University of California San Diego og European Molecular Biology Laboratory (EMBL) forskere. Teknikken er publisert 21. desember i naturprotokoller .

annonse


Målet med denne 3D-kartleggingen er å bedre forstå hvordan molekyler fra omgivelsene våre, også de som produseres av kroppene våre og de mikrobielle samfunnene på huden vår, påvirker hverandre og vår helse. Når laget tidligere brukte denne tilnærmingen til å kartlegge molekylene på huden av to frivillige, fant de utbredte spor av solkrem og andre hygieneprodukter, selv tre dager etter at de sist ble brukt.

Den 3D molekylære kartleggingsmetoden er brainchild av Pieter Dorrestein, PhD, professor i UC San Diego School of Medicine og Skaggs School of Pharmacy and Pharmaceutical Sciences, Theodore Alexandrov, PhD, teamleder hos EMBL i Tyskland, og deres lag. De bestemte hvordan best å samle prøvene, bestemme deres kjemiske sammensetning ved hjelp av massespektrometri, og bygge kartleggingsprogramvaren som ble brukt til analyse.

Etter at de ble kontaktet av mange kolleger fra felt som var så forskjellige som forensikk, kosmetikk, økologi og landbruk, konverterte forskerne 3D molekylær kartlegging metoden til en trinnvis oppskrift med intuitiv programvare og gjorde den tilgjengelig for det globale vitenskapelige samfunn.

Medforfattere av denne studien inkluderer: Ivan Protsyuk (medforfatter for første gang), Luca Rappez, Prasad Phapale, Sergey Ryazanov, EMBL; Alexey V. Melnik (medforfatter for første gang), Louis-Felix Nothias (medforfatter for første gang), Alexander A. Aksenov, Amina Bouslimani, UC San Diego.

Denne forskningen ble finansiert delvis av National Institutes of Health (5P41GM103484-07, GMS10RR02912101), Nasjonalt institutt for rettferdighet (2015-DN-BX-K047), EUs Horizon 2020 forsknings- og innovasjonsprogram, Marie Skłodowska-Curie Action og 3D-Plant2Cells.

annonse



Historie Kilde:

Materialer levert av University of California - San Diego . Original skrevet av Heather Buschman, Ph.D .. Merk: Innholdet kan redigeres for stil og lengde.


Tidsreferanse :

  1. Ivan Protsyuk, Alexey V Melnik, Louis-Felix Nothias, Luca Rappez, Prasad Phapale, Alexander A Aksenov, Amina Bouslimani, Sergey Ryazanov, Pieter C Dorrestein, Theodore Alexandrov. 3D molekylær kartografi ved hjelp av LC-MS tilrettelagt av Optimus og 'ili programvare . Naturprotokoller, 2017; 13 (1): 134 DOI: 10, 1038 / nprot.2017.122