Populære Innlegg

Redaksjonens - 2019

RNA: Den ukjente livsstilen

Anonim

Ingen hadde sjekket før, men RNA, nukleinsyren involvert i mange cellefunksjoner, inkludert proteinsyntese, synes å være den eneste "livsstrengen" for ikke å ha knuter.

annonse


I løpet av årene har fremskritt i strukturell biologi fastslått at både proteiner og DNA, selv om de er underlagt evolusjonært utvalg, ikke unnslipper den statistiske loven, der en uavhengig lengre og komprimert molekylær streng uunngåelig vil bli innfestet. Imidlertid hadde ingen hittil sett på saken av RNA.

Ved hjelp av den strukturelle beskrivelsen som tilbys for ca. 6.000 RNA-kjeder som er inngått i Protein Data Bank, en offentlig database som gjør at forskere kan dele informasjon om strukturen av proteiner, DNA og RNA, Cristian Micheletti og Marco Di Stefano fra SISSA og Henri Orland fra CEA i Saclay satt ut på et søk etter knuter.

"Vi forventet dette lange fleksible molekylet for å oppføre seg som de andre - DNA og proteiner - danner knuter med en viss frekvens, " forklarer Micheletti. "I stedet var vi i en overraskelse: ut av 6000 kjente strukturer viste bare tre tilfeller" mistenkte "knuter."

Mistenkt, fordi de tre sakene faktisk kunne være gjenstander. "Databasen inneholder flere beskrivelser av det samme molekylet som er innført av separate forskergrupper ved hjelp av ulike eksperimentelle teknikker med varierende oppløsning. Sammenligning av alternative beskrivelser av våre" knutede RNA "-kandidater fant vi ingen forekomster av knuter. Det kan være at de tre tilfellene er gjenstander bekreftet av det faktum at de alternative, ukjente beskrivelsene i alle tre tilfeller var basert på den mest nøyaktige teknikken, dvs. røntgenkrystallografi. "

Naturlig forekommende RNA er derfor en type molekyl som har en tendens til å ta på seg spesielt enkle geometriske konfigurasjoner. "Dataprognoser viser at hvis vi skulle re-arrangere naturlig forekommende RNA-sekvenser tilfeldig, ville vi oppnå langt mer entanglede og komplekse strukturer, " forklarer Micheletti. "De grunnleggende årsakene til denne avvæpende enkelheten er sannsynligvis mangfoldig, " fortsetter Di Stefano. "Det er plausibelt at den kjemiske sammensetningen av naturlig forekommende RNA utviklet for å sikre pålitelig og rask sammenfelling i enkle, trofaste reproducerbare former som tillater jevn behandling av molekylære maskineri som dekoder dem for å syntetisere proteiner. Enhver knute vil negativt påvirke prosessen." Nå er det behov for ytterligere undersøkelser for bedre å forstå RNAs anti-knuteegenskaper.

annonse



Historie Kilde:

Materialer levert av International School of Advanced Studies (SISSA) . Merk: Innholdet kan redigeres for stil og lengde.


Tidsreferanse :

  1. Cristian Micheletti, Marco Di Stefano og Henri Orland. Fravær av knuter i kjente RNA strukturer . PNAS, 2. februar 2015 DOI: 10.1073 / pnas.1418445112